與季節性流感一樣，人感染甲型H1N1流感的嚴重程度也各有不同，從輕微到嚴重不等。在2005年至2009年1月期間，美國發現過12起人感染甲型H1N1流感病例，未出現死亡病例。但是，甲型H1N1流感感染也會造成嚴重后果。1988年9月1日，威斯康星州一位身體一向健康的32歲孕婦在感染甲型H1N1流感后因肺炎住院接受治療，但8天后死亡。1976年發生于新澤西州迪克斯堡的甲型H1N1流感暴發造成200多起病例，多人患上嚴重疾病，1人死亡。此次的甲型H1N1流感流行中，墨西哥18例確診病例全部死亡。